أولا : الفقه والأصول 1 - أنيس المجتهدين في أصول الفقه 2 - أنيس التاجر في مسائل التجارة ، وورد بلفظ " أنيس التجار " 3 - تجريد الأصول ، وهو في أصول الفقه 4 - التحفة الرضوية في المسائل الدينية 5 - رسالة فقهية في العبادات 6 - رسالة في مناسك الحج 7 - رسالة في الفقه 8 - رسالة في الاجماع ، فرغ من تأليفها في شوال عام 1180 ه 9 - الرسالة العلمية في العبادات 10 - رسالة في منجرات المريض 11 - لوامع الاحكام في فقه شريعة الإسلام 12 - لمعات الشرعية 13 - معتمد الشيعة في أحكام الشريعة 14 - مناسك الحج ثانيا : الفلسفة وعلم الكلام 1 - أنيس الموحدين في أصول الدين 2 - جامع الافكار ونافذ الانظار 3 - جامع السعادات ، ويقع في ثلاثة اجزاء ، وقد شرحه ولده الشيخ أحمد النراقي المتوفى عام 1244 ه وسماه " معراج العلاء " 4 - كتاب في أصول الدين 5 - اللمعة الإلهية في الحكمة المتعالية 6 - معراج السعادة 7 - نخبة البيان